Ders Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | AKTS | |
Sistematik Biyoloji | MBG217 | 3 | 3 + 0 | 4,0 |
Birim Bölüm | MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK |
Derece Seviye | Lisans - Seçmeli - Türkçe |
Dersin Verilişi | anlatım, sunum, soru –cevap, |
EBS Koordinatörü | Prof. Dr. Mustafa KOYUN |
Ders Veren | Prof. Dr. Mustafa KOYUN |
Amaç |
Sistematik biyolojideki uygulamaları araştırmak Yaşamın çeşitliliğini ve değerini kavramak ve canlılar aleminin beş temel taksasını incelemek Modern sistematik analizleri kapsamında filogeni, taksonomi ve evrim kavramlarını incelemek Biyoçeşitlilik informatiğini ulusa ve uluslararası organizasyon ve vertabanları kapsamında incelemek |
Ders İçeriği |
Biyosferin çeşitliliğine genel bir bakış; türler ve türleşme; çağdaş taksonominin terimleri ve kavramları; filogeni, homoloji, analoji; taksonomiye fenetik ve kladistik yaklaşımlar; Morena, Fungi, Protista, Plantae ve Animalia sistematiği |
Ders Kaynakları |
Phylogenetic Systematic. Translated by D. Dwight Davis & Rainer Zangeri, Illions Ressue, 1999.
Yılmaz, İ. 2012. Taksonomik Zoolojinin Prensip ve Metotları, Sürat Üniversite Yayınları, İstanbul, 245s.
Özkan, M. 1988. Taksonominin Prensipleri, Fen-Edebiyat Fakültesi Yayınları No: 45, Fen Kesimi Yayınları No: 15, Biyoloji Bölümü Yayınları No: 8, Fen-Edebiyat Fakültesi Ofset Tesisleri, Erzurum, 138s.
|
Açıldığı Öğretim Yılı | 2015 - 2016 2016 - 2017 2017 - 2018 2019 - 2020 2020 - 2021 2021 - 2022 2022 - 2023 2023-2024 2024 - 2025 |
Yarıyıl İçi Çalışmalar | Katkı Yüzdesi (%) |
Ara Sınav 1 | 40 |
Toplam | 40 |
Yarıyıl Sonu Çalışmalar | Katkı Yüzdesi (%) |
Final | %60 |
Toplam | %60 |
Yarıyıl İçinin Başarıya Oranı | %40 |
Yarıyıl Sonu Çalışmalar | %60 |
Toplam | %100 |
Kategori | Ders İlişki Yüzdeleri (%) |
Aktarılabilir Beceri Dersleri
|
0
|
Beşeri, İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri
|
0
|
Destek Dersleri
|
0
|
Ek Dersler
|
0
|
Kategori
|
0
|
Mesleki Seçmeli Dersler
|
100
|
Temel Meslek Dersleri
|
0
|
Uygulama Dersleri
|
0
|
Uzmanlık / Alan Dersleri
|
0
|
Yetkinlik Tamamlayıcı Ders
|
0
|
Ders İş Yükü | Öğretim Metotlar / Öğretim Metodu | Süresi (Saat) | Sayısı | Toplam İş Yükü (Saat) |
Dinleme ve anlamlandırma | Ders | 14 | 1 | 14 |
Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme | Tartışmalı Ders | 14 | 1 | 14 |
Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme, takım çalışması | Beyin Fırtınası | 14 | 3 | 42 |
Ara Sınav 1 | Ara Sınav 1 | 14 | 1 | 14 |
Final | Final | 18 | 1 | 18 |
Toplam İş Yükü (Saat) | 102 | |||
AKTS = Toplam İş Yükü (Saat) / 25.5 (s) | 4 | |||
AKTS | 4,0 |
Hafta | Konu | Öğretim Metodu |
---|---|---|
1 | Prokaryotlara giriş • Jeolojik zaman ölçeği, yaşam tarihindeki önemli olaylar • Seri endosimbiyoz hipotezi aracılığıyla ökaryotların kökeni • Kambriyen patlaması ve “uyarlanabilir radyasyon” • Fosil kaydı – tarihleme ve “Yaşayan fosiller” • Tarih öncesi/tarihsel yok oluşlar ve yaşamın çeşitliliği • Baskın grupların yükselişi ve düşüşü: - Kıtaların kayması, kitlesel yok oluşlar | Tartışmalı Ders |
2 | . Evrim • Evrim teorisi • Darwinci evrim - modifikasyonla türeme • Doğal seçilim • "Modifikasyonla türeme"nin kanıtı • Türler - bunlar nelerdir? - Biyolojideki en eski sorunlardan biri - Tür Kavramları - Türleri nasıl tanımlarız? - Biyolojik Tür Kavramı - Morfotür Kavramı - Filogenetik Tür Kavramı | Tartışmalı Ders |
3 | Yaşam çeşitliliğinin takdiri • Biyolojik organizasyon seviyeleri • Biyoçeşitlilik - Tanım ve seviyeler - Biyoçeşitliliğin değerleri - Biyoçeşitliliğin tahmini “Dünyada ve Okyanusta Kaç Tür Var?” - Biyoçeşitliliğin “sıcak noktaları” - Tehditler, türlerin yok oluşu ve küresel biyoçeşitlilik krizi “Neden Kaç Tür ve Kaybı Konusunda Endişeleniyoruz?” • Koruma biyolojisi | Tartışmalı Ders |
4 | Filogenetik Alem örneklerine Giriş Monera Krallığı - Eubacteria ve Archaebacteria Protista Krallığı veya Protoctista Krallığı | Tartışmalı Ders |
5 | Mantarlar Alemi | Tartışmalı Ders |
6 | . Bitkiler Alemi • Başlıca Bitki Grupları: - Bryophytes—damarsız bitkiler - Pteridophytes — damarlı, tohumsuz bitkiler - Tohumlu bitkiler – Gymnospermler ve Angiospermler | Tartışmalı Ders |
7 | . Hayvanlar Alemi • Omurgasızlar • Süngerler • Knidaryalılar • Solucanlar • Yumuşakçalar • Eklembacaklılar • Derisidikenliler | Tartışmalı Ders |
8 | Ara sınav | Öğrenci Topluluğu Faaliyetleri / Projeleri |
9 | . Biyolojik Sistematiğe Giriş, Yaşamın çeşitliliği nasıl organize edilir? Tüm bu çeşitlilik nasıl sınıflandırılır? • Biyolojik sistematik, • Taksonomi, • Tanımlama, Tanımlama, Sınıflandırma, Koleksiyonlar, Koruma • Dünya'nın biyolojik çeşitliliğinin depolarını düzenlemek ve yönetmek • Biyolojik ç eşitliliği haritalamak ve yeni türler, yeni özellikler bulmak. | Tartışmalı Ders |
10 | . Monofiletik, parafiletik ve polifiletik gruplama - Dış grup karşılaştırması • Filogenetik • Filogenetik ağaçlar ve zamanlama - Filogramlar - Ultrametrik Ağaçlar • Moleküler Sistematik - Ribozomal RNA, kloroplast DNA ve mitokondriyal DNA - Maksimum Parsimoni ve Maksimum Olasılık • Evrensel Yaşam Ağacı | Tartışmalı Ders |
11 | Taksonominin tarihi • Lamarck Öncesi, Darwin Öncesi - “Filogeni olmadan sınıflandırma” • Lamarck ve Darwin'den Hennig'e (vd.) “Filogeni ile sınıflandırma ancak tekrarlanabilir bir yöntem olmadan” - Tekrarlanabilir bir yöntemin olmaması 1960'larda 3 büyük yaklaşımın patlamasına neden oldu: I. Fenetik - Hennig (vd.)'den günümüze - “Filogeni ve tekrarlanabilir bir yöntem ile sınıflandırma” II. Kladistik III. Filogenetik Geri bildirim gönder Yan paneller Geçmiş Kaydedilenler | Tartışmalı Ders |
12 | Modern Taksonomi • Araçlar - dijital görüntüleme, veritabanları • Dağıtım – www • Araçlar - Moleküler veriler, tür sınırlandırma, filocoğrafya “E-Bilim Olarak Taksonomi” • Fenotipik veri yönetimi • Moleküler veriler • Proteinler, Kromozomlar, DNA barkodlama “Yaşam ansiklopedisini yazmaya doğru: DNA barkodlamaya giriş • DNA dizi verileri, PCR, Mitokondriyal genom, rRNA genleri, 22 tRNA geni • DNA kullanılarak tür sınırlandırma • Filocoğrafya - MtDNA ve Ekoloji | Tartışmalı Ders |
13 | Biyoçeşitlilik bilgisi/bilişim • Biyoçeşitlilik bilgisi “Biyoçeşitlilik değerlendirmesi için işbirlikçi, küresel bir altyapıya doğru” • Önemli nesiller-DELTA | Tartışmalı Ders |
14 | Uluslararası ve Ulusal perspektif/çabalar/VERİTABANLARI • Biyoçeşitlilik ve Biyolojik Koleksiyonlar Web Sunucusu • Küresel Biyoçeşitlilik Bilgi Tesisi (GBIF) • Biyosis Taksonomisi ve Adlandırması • Yaşam Ağacı • TreeBase: Filogenetik bilgi veritabanı • Yaşam Barkodu | Tartışmalı Ders |
Ders Öğrenme Çıktısı | Ölçme Değerlendirme | Öğretim Metodu | Öğrenme Faaliyeti |
Türlerin farklılaşması | |||
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | |||
Tür tanımları | |||
Tür içi kategoriler | |||
Taksonomik Hiyerarşi | |||
Türlerin farklılaşması | |||
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | |||
Tür tanımları | |||
Tür içi kategoriler | |||
Taksonomik Hiyerarşi | |||
Türlerin farklılaşması | |||
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | |||
Tür tanımları | |||
Tür içi kategoriler | |||
Taksonomik Hiyerarşi | |||
Türlerin farklılaşması | |||
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | |||
Tür tanımları | |||
Tür içi kategoriler | |||
Taksonomik Hiyerarşi |
DERS ÖĞRENME ÇIKTISI |
PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ | PÇ |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Türlerin farklılaşması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür tanımları | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür içi kategoriler | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Taksonomik Hiyerarşi | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Türlerin farklılaşması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür tanımları | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür içi kategoriler | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Taksonomik Hiyerarşi | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Türlerin farklılaşması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür tanımları | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür içi kategoriler | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Taksonomik Hiyerarşi | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Türlerin farklılaşması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Sistematik ve Taksonomi kavramlarının açıklanması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür tanımları | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Tür içi kategoriler | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Taksonomik Hiyerarşi | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ;
Ortalama Değer | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |