| Ders Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | AKTS | |
| Genom Analizi | MBG5046 | 3 + 0 | 7,5 |
| Birim Bölüm | MOLEKÜLER BİYOLOJİ - YL |
| Derece Seviye | Lisansüstü - Seçmeli - Türkçe |
| Dersin Verilişi | DÖNEMSEL ŞARTLARA GÖRE YÜZ YÜZE VEYA UZAKTAN EĞİTİM ŞEKLİNDE |
| EBS Koordinatörü | Dr. Öğr. Üyesi Emrah KAYGUSUZ |
| Ders Veren | Dr. Öğr. Üyesi Emrah KAYGUSUZ |
| Amaç |
Genetik hastalıkların tanısında ve genom analizinde kullanılan yeni nesil yöntemlerin çalışma prensiplerini öğrenmeleri ve alanları ile ilgili problemlere bu teknikleri kullanarak çözüm oluşturabilmeleri için gerekli bilgi donanımının oluşturulması ve bu tür araştırmaları bağımsız yürütebilmeleri için bir temel oluşturulması hedeflenmektedir |
| Ders İçeriği | |
| Ders Kaynakları |
Genomik Analiz İçin Biyoinformatik Yöntemler, Muhammet Şakiroğlu, Palme Yayınevi
Biyologlar için Biyoenformatik, Pavel Pevzner ve Ron Shamir, Çeviri editörü: Zeki Kaya, Cambridge University Press Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, T.A. Brown, WILEY Blackwell |
| Açıldığı Öğretim Yılı | 2023-2024 |
| Yarıyıl İçi Çalışmalar | Katkı Yüzdesi (%) |
| Ödev 1 | 20 |
| Ödev (Sunum) | 20 |
| Toplam | 40 |
| Yarıyıl Sonu Çalışmalar | Katkı Yüzdesi (%) |
| Dönem Sonu Uygulaması | %60 |
| Toplam | %60 |
| Yarıyıl İçinin Başarıya Oranı | %40 |
| Yarıyıl Sonu Çalışmalar | %60 |
| Toplam | %100 |
| Kategori | Ders İlişki Yüzdeleri (%) |
|
Aktarılabilir Beceri Dersleri
|
0
|
|
Beşeri, İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri
|
0
|
|
Destek Dersleri
|
0
|
|
Ek Dersler
|
0
|
|
Kategori
|
0
|
|
Mesleki Seçmeli Dersler
|
0
|
|
Temel Meslek Dersleri
|
0
|
|
Uygulama Dersleri
|
0
|
|
Uzmanlık / Alan Dersleri
|
0
|
| Ders İş Yükü | Öğretim Metotlar / Öğretim Metodu | Süresi (Saat) | Sayısı | Toplam İş Yükü (Saat) |
| Toplam İş Yükü (Saat) | 0 | |||
| AKTS = Toplam İş Yükü (Saat) / 25.5 (s) | 0 | |||
| AKTS | ||||
| Hafta | Konu | Öğretim Metodu |
|---|---|---|
| 1 | Dersin tanımı ve biyoinformatik ile ilgili genel kavramlar | Ders |
| 2 | Kullanılacak programları ve veritabanlarını tanıma | Ders |
| 3 | Genom analiz teknolojilerinin gelişimi | Ders |
| 4 | Genom Haritalama ve Bağlantı Analizi, tanımlamalar | Ders |
| 5 | Gen Haritalaması ve Bağlantı Analizi, kullanılan araçlar, prensipler | Ders |
| 6 | DNA ve Genom Sekanslama Yöntemleri | Ders |
| 7 | Genlerin Keşfi,Genlerin dizi analiz datalarından tanımlanması, Tam uzunluklu cDNA oluşturma, | Ders |
| 8 | Yeni Nesil Genom Analiz Teknolojileri-Prensipleri, yararları, umutlar | Ders |
| 9 | Yeni Nesil Genom Analiz Teknolojileri-Illumina Sistemi | Ders |
| 10 | Yeni Nesil Genom Analiz Teknolojileri-Nanopore Teknolojisi | Ders |
| 11 | Genom hastalık ilişkisi | Ders |
| 11 | Araştırma sonuçlarının yorumlanması ve raporlanması | Ders |
| 11 | Araştırma sonuçlarının yorumlanması ve raporlanması | Ders |
| 13 | Seçilen makalelerin öğrenciler ile birlikte tartışılması | Ders Tartışmalı Ders |
| 14 | Seçilen makalelerin öğrenciler ile birlikte tartışılması 2 | Ders Tartışmalı Ders |
| Ders Öğrenme Çıktısı | Ölçme Değerlendirme | Öğretim Metodu | Öğrenme Faaliyeti |
| Genomik araştırmalarda kullanılan yöntemleri bilir ve literatürden okuyarak anlayabilir ve yorumlayabilir. | Yazılı Sınav | Tartışmalı Ders | Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme |
| Mutasyonların moleküler düzeyde tanımlanmasına ve araştırılmasına olanak sağlayan yöntemleri bilir. | Yazılı Sınav Ödev / Proje | Tartışmalı Ders | Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme |
| Veri bankalarından yararlanılarak bilgisayar genetiği yöntemleriyle genomların analizi ve bunların birbirleriyle karşılaştırılması | Yazılı Sınav Ödev / Proje | Tartışmalı Ders | Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme |
DERS ÖĞRENME ÇIKTISI |
PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Genomik araştırmalarda kullanılan yöntemleri bilir ve literatürden okuyarak anlayabilir ve yorumlayabilir. | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Mutasyonların moleküler düzeyde tanımlanmasına ve araştırılmasına olanak sağlayan yöntemleri bilir. | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Veri bankalarından yararlanılarak bilgisayar genetiği yöntemleriyle genomların analizi ve bunların birbirleriyle karşılaştırılması | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
